Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTP11Q9Y3A2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP11Q9Y3A2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms