Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms