Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN7L1Q9ULK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN7L1Q9ULK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms