Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms