Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3AQ9NVI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms