Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBN1Q9NPG3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBN1Q9NPG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBN1Q9NPG3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.4 ms