Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3GQ9HC16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1750.3 ms