Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms