Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOQ99835 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMOQ99835 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMOQ99835 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMOQ99835 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMOQ99835 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOQ99835 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOQ99835 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOQ99835 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOQ99835 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOQ99835 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOQ99835 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOQ99835 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOQ99835 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMOQ99835 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOQ99835 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms