Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACAP3Q96P50 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAP3Q96P50 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACAP3Q96P50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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