Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF6Q96J87 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms