Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLUAP1Q96AJ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLUAP1Q96AJ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUAP1Q96AJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms