Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A9Q8NBW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A9Q8NBW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms