Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP2LQ8IYA6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CKAP2LQ8IYA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CKAP2LQ8IYA6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CKAP2LQ8IYA6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CKAP2LQ8IYA6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2LQ8IYA6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP2LQ8IYA6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CKAP2LQ8IYA6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms