Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP30Q70CQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP30Q70CQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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