Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFXL1Q6ZNB6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms