Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK2Q16620 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK2Q16620 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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