Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN1Q14699 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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