Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED1Q13445 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TMED1Q13445 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TMED1Q13445 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TMED1Q13445 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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