Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN3Q13064 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN3Q13064 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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