Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF2Q01130 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF2Q01130 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF2Q01130 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms