Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOAP61586 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOAP61586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOAP61586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOAP61586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOAP61586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOAP61586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOAP61586 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOAP61586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOAP61586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOAP61586 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOAP61586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOAP61586 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOAP61586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOAP61586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOAP61586 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOAP61586 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOAP61586 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOAP61586 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOAP61586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOAP61586 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOAP61586 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms