Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCE1P61221 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms