Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP1P59025 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP1P59025 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP1P59025 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP1P59025 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP1P59025 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP1P59025 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP1P59025 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP1P59025 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP1P59025 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP1P59025 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP1P59025 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP1P59025 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP1P59025 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP1P59025 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP1P59025 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP1P59025 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP1P59025 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP1P59025 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP1P59025 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP1P59025 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP1P59025 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP1P59025 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms