Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CLTCL1P53675 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCL1P53675 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCL1P53675 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCL1P53675 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms