Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT4P50991 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT4P50991 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT4P50991 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT4P50991 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCT4P50991 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT4P50991 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT4P50991 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT4P50991 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT4P50991 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT4P50991 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT4P50991 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT4P50991 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT4P50991 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT4P50991 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT4P50991 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT4P50991 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT4P50991 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT4P50991 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT4P50991 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT4P50991 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCT4P50991 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCT4P50991 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCT4P50991 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms