Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A3P48751 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A3P48751 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A3P48751 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms