Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSOP43234 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSOP43234 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSOP43234 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSOP43234 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSOP43234 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSOP43234 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSOP43234 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSOP43234 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSOP43234 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSOP43234 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSOP43234 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSOP43234 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSOP43234 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSOP43234 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSOP43234 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSOP43234 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSOP43234 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSOP43234 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSOP43234 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSOP43234 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSOP43234 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSOP43234 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSOP43234 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSOP43234 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms