Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN7P41732 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN7P41732 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms