Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCAP28676 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCAP28676 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCAP28676 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCAP28676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCAP28676 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCAP28676 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCAP28676 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCAP28676 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCAP28676 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms