Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRR1P24046 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRR1P24046 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms