Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCP20941 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCP20941 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCP20941 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCP20941 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCP20941 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCP20941 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCP20941 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDCP20941 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCP20941 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCP20941 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCP20941 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCP20941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCP20941 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCP20941 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCP20941 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCP20941 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCP20941 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCP20941 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCP20941 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCP20941 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCP20941 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCP20941 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCP20941 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms