Protein–RNA interactions for Protein: P13726

F3, Tissue factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P13726 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F3P13726 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F3P13726 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F3P13726 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F3P13726 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F3P13726 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F3P13726 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F3P13726 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F3P13726 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F3P13726 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F3P13726 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F3P13726 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F3P13726 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F3P13726 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F3P13726 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F3P13726 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F3P13726 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F3P13726 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F3P13726 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F3P13726 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F3P13726 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms