Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAMP11215 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms