Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPNS1P04632 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1P04632 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1P04632 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms