Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP1O75113 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms