Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLIN3O60664 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms