Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRTM2O43300 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRTM2O43300 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRTM2O43300 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRTM2O43300 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRTM2O43300 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRTM2O43300 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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