Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms