Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UMAD1C9J7I0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UMAD1C9J7I0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UMAD1C9J7I0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms