Protein–RNA interactions for Protein: A8MUI8

Putative UPF0607 protein ENSP00000383783, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUI8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A8MUI8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A8MUI8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A8MUI8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A8MUI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A8MUI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A8MUI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A8MUI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A8MUI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A8MUI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A8MUI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A8MUI8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A8MUI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A8MUI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A8MUI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A8MUI8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A8MUI8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A8MUI8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A8MUI8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms