Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms