Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms