Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRK4

LOC107984640, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC107984640A0A0U1RRK4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOC107984640A0A0U1RRK4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOC107984640A0A0U1RRK4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms