Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN7Q9Y6W3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms