Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARFGEF2Q9Y6D5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms