Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX4Q9Y2E6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX4Q9Y2E6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.7 ms