Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM7Q9UK45 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSM7Q9UK45 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM7Q9UK45 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms