Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS18Q9P253 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS18Q9P253 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms