Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCMF1Q9P0J7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms